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盤點重組蛋白表達實驗中設計上的一些表達異常分析

發(fā)表時間:2022-12-01 訪問次數(shù):1039

  重組蛋白表達實驗中,即便是完全按照自己設計的程序來操作,也可能會出現(xiàn)各種各樣的問題,只要這些問題出現(xiàn),基本上就代表我們的實驗沒成功。其實,實驗做多了之后,這種問題可以說是非常的普遍。有鑒于此,普健生物就和大家總結一下有關重組蛋白表達過程中常見的一些表達異常的情況及其解決辦法。

  1、密碼子位移。外源基因序列內(nèi)部核糖體結合位點出現(xiàn)偏移,或者受到一些其他因素干擾,導致密碼子出現(xiàn)位移的情況;

  2、稀有子密碼問題。我們可以使用相關軟件對稀有子密碼進行分析,在進行重組表達之前,對蛋白序列進行優(yōu)化。我們紙袋,在蛋白表達起始位點前的15個氨基酸密碼子至關重要,連續(xù)的兩個稀有子密碼可能會造成表達效率降低的情況。所以,我們可以通過對其進行優(yōu)化,避免如上可能會出現(xiàn)的問題后再進行表達;

  3、信號肽表達問題。一般來說,大腸桿菌缺乏加工蛋白信號肽的機制,所以,我們在進行相關真核表達時候,需要引起額外的注意;

  4、GC含量高問題。一般來說,基因序列中GC含量超過70%的時候,就很難進行蛋白表達了,想要表達成功,我們只能進行相關優(yōu)化工作,降低其中GC含量后再表達;

  5、蛋白大小異常問題。小于10KD或者大于100KD的蛋白都難以表達,如果遇到這種蛋白,可考慮使用其他辦法;

  6、蛋白標簽選擇問題。通常我們需要在蛋白表達中加入各種標簽,可一些標簽會影響蛋白表達,甚至造成蛋白表達不成功。這個時候,我們就需要考慮采用一些易于表達的標簽,不要選擇難以表達的標簽;

  在重組蛋白表達的過程中,我們常常會遇到這樣或者那樣的問題,一般來說,我們只需要根據(jù)實驗的要求來進行,都不會出現(xiàn)什么問題。牢記如上的六點,在表達過程中多注意相關情況,相信蛋白表達失敗的概率不會太高。普健生物專業(yè)為廣大用戶提供重組蛋白表達服務,如果您有相關需求,歡迎來電咨詢。

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